Es Anestesista-reanimador en la red pública de hospitales desde 1997. Cofundador en 1971 de Médicos Sin Fronteras, del cual es Presidente y Presidente Honorario durante 15 años. De 1998 a 1992 es Médico-Jefe de la penitenciaría de Fleury Merogis (Departamento de Essone). En 1993, funda el Samu Social de París (primeros auxilios), el cual preside todavía. De 1995 a 1997 asume el cargo de Secretario de Estado Encargado de la Acción Humanitaria de Urgencia. En 1998 se ocupa de la creación del Samu Social Internacional, que dirige desde entonces. Es igualmente Presidente de varias organizaciones que él mismo ayudó a crear: el Alto Comité para el Alojamiento de personas desfavorecidas desde 1997, la Asociación “La Casa Abierta” desde 2003. Finalmente, es Presidente la Fundación Médéric Alzheimer desde 1999. Emmanuelli ha publicado un gran número de libros y de ensayos, los cuales abordan a la vez su experiencia y su análisis de las problemáticas de la urgencia y de la exclusión.